V těchto skupinách došlo ke zkrácení doby odpisování. Dále byla zavedena nová skupina 1a s dobou odpisování 4 roky, do níž spadají osobní automobily a vozidla, jež mají v technickém průkazu označení N1. Motorová vozidla
pro přepravu 10 a více osob byla přeřazena z 1. do 2. odpisové skupiny.

Reinvestiční odpočet ve výši 10, 15 nebo 20 % pořizovací ceny hmotného majetku zařazeného ve skupinách 1 až 3 bylo možné naposledy uplatnit u majetku zaevidovaného do konce zdaňovacího období započatého v roce 2004. Dle přechodného ustanovení je možné ve zdaňovacím období započatém v roce 2005 a následujících obdobích dočerpat nárok na odpočet vzniklý do konce roku 2004, pokud nebylo možné ho uplatnit z důvodu nízkého základu daně. Jako kompenzaci za zrušení tohoto odpočtu lze považovat možnost zvýšit odpisy v prvním roce odpisování, což se promítne do postupného snížení základu daně vždy už pouze do 100 % pořizovací ceny majetku, nikoliv 110 až 120 %, jako tomu bylo
do konce roku 2004.

Každé další technické zhodnocení zvyšuje vstupní cenu původního majetku s výjimkou technického zhodnocení na nemovité kulturní památce, které se odpisuje vždy samostatně.

Omezení vstupní ceny pro odpisování osobních aut se zvýšilo z původních 900 000 Kč na 1 500 000 Kč. Při prodeji takového automobilu lze do výše příjmů z prodeje určitým způsobem zohlednit v základu daně vedle daňové zůstatkové ceny automobilu rovněž částku, o kterou původní pořizovací cena převyšovala daňový limit vstupní ceny.

Přechodné ustanovení objasňuje postup u budov zařazených do majetku do konce zdaňovacího období započatého v roce 2003. Tyto budovy se do 6. odpisové skupiny nepřetřiďují a doodepíšou se podle původních pravidel. 6. odpisová skupina (doba odpisování 50 let) se použije až u budov zařazených do majetku po tomto datu. Novela dále přeřazuje zpět do 5. odpisové skupiny budovy škol, univerzit a budovy užívané pro výzkum.

Již novelou pro rok 2004 bylo zavedeno měsíční odpisování nehmotného majetku. Pro zdaňovací období započaté v roce 2005 došlo k doplnění skupin majetků: 36 měsíců se odepisuje software a nehmotné výsledky výzkumu a vývoje; 18 měsíců audiovizuální díla; 60 měsíců zřizovací výdaje a 72 měsíců ostatní nehmotný majetek.
I nadále platí, že u nehmotného majetku, ke kterému má poplatník právo užívání na dobu určitou, se roční odpis stanoví jako podíl vstupní ceny a sjednané doby užívání.

Vzhledem k tomu, že od roku 2001 došlo k několika změnám v oblasti odpisování nehmotného majetku, mohou u jednoho poplatníka existovat zároveň tři skupiny nehmotného majetku z pohledu metod odpisování. Do první skupiny bude spadat majetek zaevidovaný do konce zdaňovacího období započatého v roce 2000, který se odepisuje podle zařazení do odpisových skupin dle tehdy platného zákona. Druhou skupinu tvoří nehmotný majetek zaevidovaný v období započatém v roce 2001 do konce období započatého v roce 2003, pro který platí, že daňově uznatelné jsou rovny účetním odpisům nehmotného majetku.

A konečně třetí skupinu tvoří nehmotný majetek zaevidovaný v období započatém od roku 2004 odepisovaný dle v současnosti platných pravidel v zásadě podle měsíčních odpisů.